? ? 阿森纳利物浦:北京組學生物科技有限公司 - 阿森纳爆冷输球
阿森纳爆冷输球 > 科技服務 > 轉錄組 > Small RNA測序 >
Small RNA測序
產品簡介

           Small RNA測序 (Small RNA 主要包括 microRNA、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三類。Small RNA 測序是基于Illumina HiSeq2500 測序平臺,研究特定組織在特定狀態下的所有已知 small RNA,也可發現物種或組織特異 small RNA 并預測其靶基因,為研究 small RNA 的功能及基因調控機制提供了有力工具。

技術流程



樣品要求

1)樣品類型:完整且無污染的總RNA;
 
2)樣品需求量:≥10 μg;
 
3)樣品濃度:植物和真菌樣品≥200 ng/μl;
 
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230=1.8~2.2;28S:18S≥1.5;RIN≥8.0;昆蟲樣本無此指標。

案例解析

案例一:miRNA測序研究綿羊脂肪組織積貯機制[1]

    研究中對兩種綿羊(小尾寒羊和陶賽特羊)的脂肪組織進行RNA-seq測序分析,共發現3132個miRNAs,其中2893個位全新miRNAs。差異表達分析共發現54個miRNAs表達存在差異,而與這些差異表達miRNAs相關的靶基因的GO和通路分析發現:miRNAs的表達量和其靶基因的表達量成負相關,小尾寒羊中miRNAs表達較高,抑制了脂肪組織中類脂代謝,使得小尾寒羊肉質肥美;這項研究為了解這兩種綿羊脂肪儲備分子機制提供了新的研究方向;


參考文獻

[1]Miao X, Luo Q, Qin X, Guo Y. Genome-wide analysis of microRNAs identifies the lipid metabolism pathway to be a defining factor in adipose tissue from different sheep. Scientific Reports. 2015;5:18470. doi:10.1038/srep18470.

?
科技服務 技術支持 聯系我們 阿森纳爆冷输球 關于我們