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全基因組甲基化測序
產品簡介

全基因組DNA甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺相結合,對有參考基因組的物種進行全基因組水平的甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態,從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。

技術流程

樣品要求

1)樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
 
2)樣品需求量:≥5μg;單次最低建庫起始量可降至200ng;
 
3)樣品濃度:≥50 ng/μl;
 
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.0。

案例解析

案例一:WGBS+RNA-seq揭示生殖細胞形成過程中動態去甲基化機理[1]

      人類生殖細胞形成過程中全基因組范圍的去甲基化過程的研究不是很多。本研究中,對卵細胞和精子細胞成熟前53-137天取樣進行RNA-seq和WGBS全基因組甲基化測序;與其它已發表的人類其它干細胞甲基化數據比較(Inner cell mass ICM,pluripotent stem cells PSC)發現:人類生殖細胞形成過程中甲基化水平和轉錄組表達與ICM細胞和PSC細胞存在明顯差異;


參考文獻

[1]Gkountela, Sofia et al.DNA Demethylation Dynamics in the Human Prenatal Germline. Cell, Volume 161 , Issue 6 , 1425 - 1436.

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